Проект здания не исчезает после постройки

это баг и возможно изчезнит после перезапуска

В принципе если перезапустить сейв, должно пропасть.

Это происходит из-за неправильного расчета материалов для строительства - остается один недопоставленный элемент (как правило металлическая конструкция). Причем это происходит с большими по площади зданиями.

Для решения иногда приходится загружать старый сейв (всегда сохраняюсь перед началом крупной стройки), а иногда игра докупает недостающую часть и довозит на отдельной машине.