Сиквел известной космической 3D-стратегии.
Действие игры начинается в 23 веке, вскоре после событий аддона Galactic Civilizations: Altarian Prophecy. Империя дренгинов медленно, но верно покоряет галактику, сминая всех на своем пути. В один прекрасный день завоеватели сталкиваются с Предтечами - могущественной расой сверхсуществ Dread Lords, вернувшейся из тысячелетнего забвения, чтобы показать прочим народам кузькину мать. Дренгины и их союзники объявляют войну древним захватчикам, в то время как человечество во главе с игроком накапливает силы, поскольку вне зависимости от того, кто выйдет живым из эпической схватки, земляне все равно проиграют.
Одним из изменений Galactic Civilizations 2 стал нелинейный сюжет кампании. Провалив важную миссию, игрок вместо таблички "Game Over" получает альтернативное задание, и повествование перейдет на другие рельсы. Впрочем, те, кто предпочитает стандартный "цивилизационный" геймплей, могут сыграть в обычный "skirmish" без сценарных финтов.
В битву за судьбу галактики вступят 10 рас, каждая из которых наделена уникальными чертами. Кроме того, все желающие могут создать собственный народ. Изменилось древо технологий - оно стало более "прозрачным" для понимания; появился конструктор космических кораблей и строительство флотилий. Площадь вселенной осталась прежней, но стала визуально шире из-за совмещения планетарного экрана с картой.